Istorija grada Šeki duga je preko 2.700 godina, pa je taj grad poznat kao jedno od najstarijih naselja i kulturnih centara Azerbejdžana. Šeki je poznat po surovoj, ali impresivnoj prirodi: moćni planinski venci, planinski potoci, tamnozelene šume četinara.

U prošlost je Šeki bio glavni grad Šekinskog kanata, a nakon 1805. ušao je u sastav Ruskog carstva.

Za vreme svoje duge istorije grad je bio više puta razoren u potpunosti, pa je 1772. godine izgrađen potpuno novi grad Šeki na drugom mestu. Zbog toga većina arhitektonskih spomenika u samom današnjem gradu datira iz perioda od 16. do 19. veka.

Glavna znamenitost grada je biser azerbejdžanske arhitekture palata Šekinskih hanova (18. vek), izgrađena bez ijednog eksera.

U blizini Šekija nalaze se očuvani hrišćanski spomenici drevnih država: u selu Kiš je jedinstvena crkva iz 5. veka, a na periferiji grada tvrđava zvana „Gelersen – gerersen” („Dođi – vidi”). Lepotama Šekija svojevremeno su se divili Aleksandar Dima otac, Lav Tolstoj, Mihail Ljermontov.